Yuugi asuu yhdessä peli- ja lelukauppaa pitävän isoisänsä kanssa. Hän on hieman ujo lukiolaispoika, joka rakastaa pelien pelaamista ja arvoitusten ratkaisemista. Eräänä päivänä Yuugi saa isoisältään muinaisen egyptiläisen pyramidipelin. Siitä alkaa uusi seikkailu, kun palapeli muuttaa Yuugin "Varjojen pelien" toimitsijaksi. Pian hän huomaa sisällään asustavan toisen persoonan, joka omaa salaperäisiä voimia... Uudet kyvyt tulevat tarpeeseen, sillä Yuugi ystävineen huomaa joutuvansa tämän tästä vaarallisiin tilanteisiin.