Subnautica: Below Zero on irrallinen jatko-osa Subnautica-peliin, joka sijoittuu ajallisesti Subnautican jälkeiseen aikaan, samalle planeetalle, mutta sijantina on arktinen alue 4546B. Kyseessä on vedenalainen seikkailupeli, joka sijoittuu muukalaisten valtamerimaailmaan. Sinun tehtäväsi on tutkia muukalaisten esineitä yhdessä tiedemiehen kanssa. Vesper-avaruusasema kiertää yläpuolellanne lähettämällä tarvikkeita, ohjeita ja vastaanottamalla näytteitä. Kuitenkin eräänä päivänä katastrofi iskee tutkimusasemalle, jolloin alkaa selviytymisseikkailu, jossa rakennat elinympäristöjä, etsit resursseja, ruokaa ja työkaluja. Sukella syvyyksiin jäälauttojen alla, seikkaile petollisilla jäälautoilla, kiipeä lumen peittämiin huippuihin ja tutustu jäisiin luoliin. Löydä uusia eläimiä, joista osa on vaarallisia kuten hait tai tutustu vaikkapa suloisiin pengwing eläimiin, jotka muistuttavat pingviinejä. Jotkut jäätyneen meren asukkaat auttavat Sinua, ja jotkut saattavat yrittää vahingoittaa Sinua. Keitä he ovat, miksi he ovat tulleet tänne ja voitko luottaa heihin? Sukella tarinaan ja selvitä planeetan mysteerit. Pelissä on neljä pelimuotoa, jotka ovat selviytyminen (Survival), hardcore, vapaa (Freedom) ja luova (Creative). Selviytymistila on pelaajan normaali vaikeusaste, jolla nälkä, jano ja happi ovat käytössä. Hardcore on selviytymistilan kaltainen, mutta pelaajan täytyy aloittaa täysin alusta kuollessaan. Vapaassa pelimuodossa pelaajan ei tarvitse välittää ruuasta tai vedestä. Luovassa tilassa pelaaja ei voi kuolla ja hänellä on vapaat kädet kaikkeen.